Ernst Haeckel (Potsdam, 16. veljače 1834. - Jena, 9. kolovoza 1919.), njemački zoolog i filozof-prirodoslovac.
Bio je profesor zoologije na sveučilištu u Jeni, istaknuti i borbeni Darwinov sljedbenik.
Dao je niz izvornih monografija o morskim beskralježnicima.
Postavio je teoriju gastreje, formulirao biogenetski zakon.
Zacrtao je prve genealogije životinjskog carstva i postavio teoriju o nastanku života iz nežive tvari.
Popularizator je evolucijske teorije.
Poznat je osnivač ekologije koju je definirao kao ekonomiju prirode, istraživanje totalnih odnosa organizama prema organskoj i neorganskoj okolini i kao učenje o kompleksnim međuodnosima koji su uvjet borbe za opstanak.
Kad se citira doprinos Ernsta Haeckela botaničkom imenu, rabi se kraticu Haeckel.