Specijalni agent Tajne službe, Ethan Burke, krenuo je u gradić Wayward Pines s jasnom misijom: pronaći i izvući dva federalna agenta koji su prije mjesec dana nestali u tom rustičnom mjestašcu. No, nekoliko minuta po dolasku, Ethan doživi prometnu nesreću. Osvještava se u bolnici bez identifikacijskih isprava, bez mobitela i bez svoje aktovke. Medicinsko osoblje djeluje prijateljski, no nešto tu nije u redu…
Kako dani prolaze, u Ethanovoj se glavi javlja sve više pitanja. Zašto ne može telefonirati supruzi i šefu? Zašto nitko ne vjeruje da je on agent Tajne službe?